由于历史和现实的复杂原因，多年来对河道缺少呵护，上海市不少河道，尤其是乡镇、村的一些中小河道其功能正在不断萎缩。河水黑臭、河道窄浅，河浜断头似乎成了这些河道的现实写照。90年代以来，上海历届市委市政府高度重视上海水环境建设，已滚动实施三轮环保三年行动计划，上海连续发起河道整治的攻坚战。据不完全统计，九年中，市政府已累计投资110亿元整治水环境，苏州河及中心城区河道水质有较明显改善，全市河道，尤其是中心城区的河道已基本消除黑臭。市水务局完成郊区660公里黑臭河道整治后，现在起到明年底将深入农村屋前宅后沟沟岔岔，拆坝造桥通浜，尽力恢复江南水乡风貌，并重点在污水处理上下功夫，从源头开始治污。

    今年年底的目标是，上海城市污水处理率75.5％，到2010年这个数字将达到80％，其中，中心城区污水处理率要达到96％。这些数字将根据上海用水总量产生的污水总量与处理量计算后得出，里面还包括从农村来水。目前，上海市每天的污水处理量为480万立方米，因为从一家一户接出的管网还没全部到位，因此已有的600万立方米污水处理能力尚未完全发挥。

    为推进社会主义新农村建设，上海市水务局主动“揽下”了农村生活污水处理的“份外事”。据最新统计，目前全市郊区有分散居住的农户134万户，这部分生活污水处理是个难题。上海市水务局拿来中科院土壤研究所的科研成果“渗滤法”，为农户建造污水池：投资省，占地少，每户造价约在8000至10000元间，通过市、区两级政府补贴，落实造池资金。原定明年共实施6万户，现在决定增加到10万户。这一惠民工程完工后，农户生活污水先通过管道流入自家宅基地下，经土壤吸附处理后进池，抽掉上面的水，将底下的沉淀物运走处理。上海市将努力建设好农业、农村、农民最主要的生活环境。