流域与区域存在隔阂，流域管不了区域，造成区域规划与太湖流域综合规划不接轨，“规划打架”现象时有发生。

　　“太湖流域水污染治理主要是由江、浙、沪三省（市）按块负责，但缺乏一个流域的日常监督机构。“《湖泊科学》杂志曾撰文分析，城市供水、排水、排污、水质的管理，分属城建、公用事业、环保等多个部门，在一个行政区域内，客观存在着“多头管水”的问题。最后的结果是“无人对水负责”。

　　河海大学教授崔广柏曾介绍，目前太湖流域的管理组织有太湖流域管理局、太湖渔业管理委员会等，中间存在区域隔阂，流域管不了区域，造成区域规划与太湖流域综合规划不接轨，“规划打架”现象时有发生。

　　而另一方面，太湖流域涉及两省一市35个城市，城市间也存在利益协调。秦伯强举例称：“比如上游排污，下游受难，但国内尚不存在污染权转移的解决办法，缺少利益协调部门。”

　　2006年底，联合国国际湖泊环委会专家哈里曾应无锡市要求问诊太湖，他作出《太湖水环境状况及水质修复评估报告》，认为：“建立流域领导机构至关重要。这个领导机构必须是官方机构，要由环保、水利、建设、农林等相关部门组成。这便于通盘考虑整个流域水环境修复管理措施的制订。”

　　早在去年初，太湖流域管理局曾谋划升格为太湖流域管理委员会，以解决上述问题。6月5日，吴志平接受记者采访时说，该局的“升格”工作“目前仍在前期研究中，正在做方案”，能否成行，尚需时日。

　　而即使是“升格”成功，有了协调机制之后，吴志平认为，最终还是要看各政府部门的执行力度。

　　太湖立法酝酿历史突破

　　水危机后，无锡市委书记杨卫泽的感慨是，“牺牲环境换取经济发展的结果是自取灭亡。”

　　无锡水危机后，该市大张旗鼓，宣布开始治理太湖“6699行动”，包括六大应急对策、六大工作机制、九大清源工程和九大治污措施。同时，市长毛小平宣布将提高企业排污标准；而太湖上游，6月5日，常州、武进也对上百家企业实施强制性停排和限排水污染物。

　　与此同时，太湖流域管理局水政水资源处处长吴志平透露，一项跨行政区域的流域性立法———《太湖管理条例》目前正在起草相关条文，前期准备工作已做完。其中关于太湖治污有专门的条款。

　　该条例起草准备自去年三月开始启动，在我国流域性立法中尚无先例。而更早以前，在2001年11月国务院转发的《关于加强太湖流域2001-2010年防洪建设的若干意见》中，即提出来由国务院法制办牵头制订《太湖管理条例》。

　　起草中的《太湖管理条例》旨在理顺太湖湖面和岸线管理体制、明确太湖水资源的配置、保护和治理原则。

　　“上海饮用水80%取自黄浦江，而太湖是重要来源，对上海非常重要。光有地方治理不够，还是需要流域管理。”6月5日，上海市法制办城建处处长江子浩对此表示支持。

　　“我们希望通过《太湖管理条例》搭建一个平台，水利、环保、城建、国土、农业、经贸等涉及太湖管理的部门能在这个平台上进行对话、协商，这是对现有体制的一个突破和创新。也就是变九龙治水为一龙主动、多方合作。”吴志平接受采访时曾说。

　　另有消息表明，太湖治理二期工程已于2005年通过水利部审批，目前正等待国务院批准，该工程总投入初步预算在人民币1000亿元。

　　哈里博士开出的良方是“综合、持续、广泛”。他说，必须要有一个整体、全局的“治太”计划，因为水质改善不是就事论事，而是牵一发动全身；必须要持之以恒，每届政府都要接过“接力棒”，不能中断；政府间不同部门以及各种机构的合作，包括广泛动员社会每个公民参与。

　　江苏省副省长仇和在6月1日的会议上透露，国务院不久将召开太湖会议，寻求根本途径解决太湖流域水污染状况，防止类似无锡市水危机事件再次发生。

　　水危机后，无锡市委书记杨卫泽的感慨是，“牺牲环境换取经济发展的结果是自取灭亡。”